IPA已经广泛地被生命科学研究学界接受，并且被成千上万同行审议的杂志所引用。

目前使用IPA处理数据发表文献有14600篇（2014.10.1）。

案例1

Host genetic diversity enables Ebola hemorrhagic fever pathogenesis and resistance

http://www.sciencemag.org/content/346/6212/987.abstract                                                     

Predicted Activity of TIE1 and TEK Signaling in Susceptible CC-RIX Mouse Livers

案例2

GATA2 as a potential metastasis-driving gene in prostate cancer

http://www.biomedsearch.com/nih/GATA2-as-potential-metastasis-driving/24448395.html

研究思路

IPA 进行共表达网络分析

WGCNA 分析，得到四个模块，对这四个模块分别进行IPA 功能分析，预测造成的功能激活或抑制的影响。功能验证试验与预测结论吻合。

案例3

Genes and Gene Networks Implicated in Aggression Related Behaviour

http://link.springer.com/article/10.1007/s10048-014-0417-x

研究思路

基于IPA软件及数据库构建相关与攻击行为相关的信号通路

这些基因在IPKB（Ingenuity PathwaysKnowledge Base）中，主要落在2 个pathway（MAPK和NF-kB）