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科技服务 IPA-Ingenuity Pathway Analysis
IPA 特色分析内容

IPA数据检索

查询分子类型、功能、参与的信号通路、上游的调控分子,以及疾病和功能相关的分子、biomarker、治疗药物等信息。

 

 

细胞迁移相关的分子(最优10个)

 

 

信号通路分析

 

 

可靠、全面的信号通路分析,所有的信号通路基于人工构建,具有收录信息全、调控方向可预测、原始文献可查询的特点。IPA分析不仅能将差异基因富集到经典信号通路,还能够清晰的展示该通路是激活还是抑制。

 

 

 

上游调节因子分析

 

1. 上游调节因子分析

预测引起下游基因差异表达的上游miRNA或转录因子。

 

 

2. 网络展示

 

ZMPSTE24是差异基因SOCS3、IGF1、LMNA*、JAK2、JGFBP1、ATAR5B的上游调节因子。

 

 

下游生物学功能分

 

 

通过差异基因分析,分析下游疾病和功能是促进还是抑制,输出与疾病、生物学功能、TOX function相关的基因,全面揭示与生物学效应相关的基因集以及网络。

 

 

breast cell lines 中细胞凋亡相关的基因:

 

 

分子互作网络分析

 

 

基于上传的数据从头构建网络,Networks 也包含数据集中没有的互作分子,这可以查看您的实验平台无法检测到的分子的互作信息,比如代谢物或化合物信息。还可以将生成的关键网络分子overlay到经典信号通路,使得生成的调控网络更加有意义。

 

 

因果网络分析(Causal Network Analysis)

 

因果网络分析可以帮助您建立疾病、基因和上游调节因子间的因果关系。

 

机制调控网络分析

 

 

通过整合数据集上游调节作用和下游效应结果,产生因果调控网络,从而能够快速推断哪些上游因子改变可以引起表型或功能的变化。

 

 

自定义网络构建

 

 

根据客户提供的基因、疾病、功能等有效信息来构建网络。

 

 

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