dafabet手机黄金版_dafabet黄金手机版

晶诚所至 生命所能

Engage to Life Energy

 
科技服务 基因芯片数据分析
表达谱分析

表达谱分析

通过芯片杂交信号的荧光强弱来得到mRNA,miRNA的表达量或者CpG位点的甲基化程度,利用统计学方法来筛选差异位点,@后借助功能分析来寻找可能的生物学解释。

 

基本分析流程

 

 

部分结果展示

 

Box plot图:是利用数据中的五个统计量:@小值、第@四分位数(25%)、中位数(50%)、第三四分位数(75%)和@大值来描述数据的@种方法,它也可以粗略地看出数据是否具有有对称性,分布的分散程度等信息。

 

 

Pca图:通过降维度的方式来看样本间的相似程度,不同的颜色表示不同分组的样本。样本间距离越近表示样本基因的表达趋势约接近。

 

 

火山图:两条绿色直线对应fold change 2倍差异,绿色横线对应P=0.05,红色是差异基因区域。

 

非监督聚类图:纵列表示样本横列表示基因,信号值的强度用色阶表示,进化树表示基因或者样本的相似程度。

 

自组织映射聚类SOM 分析:将变化趋势@致的基因聚类,横坐标是不同阶段,每条线表示@个基因的表达趋势。

 

Go关系图

 

Pathway图

 

网络关系图

上一条:GWAS分析
下一条:@系连锁分析
网站地图 | 法律声明 | 联系我们

地址:上海市松江区九亭镇中心路1158号5幢5楼

电话:400-9200-612  传真:+86 21 6090 1207/1208-8154

dafabet手机黄金版技术(上海)有限公司 Copyright 2012 Genergy Inc. 沪ICP备10017363号

友情链接: