Illumina针对人、小鼠的完整RNA样本开发了全基因组表达谱芯片产品（采用直接杂交的方法）, Illumina全基因组表达谱微珠芯片使得在更高通量水平上的生物学研究成为可能，可以广泛地应用于高置信度靶位点发掘，疾病分子分型和分子通路分析等研究领域上。研究人员现在可以在一张芯片上获取多个样本的全基因组表达谱。

芯片名称：Human HT-12 v4 Expression BeadChip
芯片信息：每张芯片可平行检测12个样本，含有共约48,000个基因转录本，信息来源除36,000个NCBI RefSeq外，还包含了从UniGene的12,000个转录本信息。

芯片名称：Mouse WG-6 v2 Expression BeadChip
芯片信息：每张芯片可平行检测 6 个样本，包含有约 45,281 个来自 MEMBO-RefSeq 及其补充序列，RIKEN补充序列的转录本信息。