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GWAS分析

GWAS分析

针对复杂疾病研究，通过大样本量和全基因组的tagSNP基因分型，借助统计学方法来控制人群分层等干扰因素的影响，进而识别和疾病显著关联的SNP位点，找寻潜在的易感基因。

 

基本分析流程

 

 

 

部分展示结果

 

 

利用PCA分析人群分层情况剔除异常样本

 

 

 

Q-Q plot反应样本群的分层情况，越接近1人群分层情况影响越小

 

 

 

Manhattan plot反映统计检验后p值在基因组上的分布情况

 

 

显著位点区域放大图

 

 

 

LD plot 根据LD连锁关系得到block区域,将多SNP位点与候选区域进行关联展示 

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