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基因组水平－新物种de novo 测序
Genome sequence and analysis of the tuber crop potato.
Nature. 2011 Jul 10;475(7355):189-95.
研究人员使用纯合的加倍单倍体马铃薯克隆进行高通量测序。组装得到86％的基因组，并预测到39,031个蛋白编码基因。同时研究人员还将马铃薯的杂合二倍体克隆测序，发现基因会频繁发生各种潜在的有害突变，这可能是导致近交衰退的一个原因。进一步研究表明基因家族扩展，组织特异性表达，招募基因进入新信号通路都导致了块茎发育的进化。马铃薯基因组序列的获得为这个重要农作物的遗传改良提供了一个强有力的平台。
技术路线
结果分析
不同品系的单倍型多样性
不同植物，不同组织基因表达特征
参考文献
[1] Li R, Wang J, et al. The making of a new pathogen: Insights from comparative population genomics of the domesticated wheat pathogen Mycosphaerella graminicola and its wild sister species. Genome Res. 2011, 21:57-66.
[2] Hamidreza C,Joyclyn L Y,Glenn T,et al. Efficient de novo assembly of single-cell bacterial genomes from short-read data sets.Nat Biotechnol. 2011,29:15-21.
