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全转录组测序，高分文章就指望它了
发布日期：2017-09-01浏览：
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全全转录组测序，高分文章就指望它了
>>>还在纠结是测序mRNA? microRNA? 或是 cirRNA? 还是lncRNA？
>>>纠结哪个热追哪个？哪个便宜测哪个？
>>>不用啦，全转录组测序来帮忙！
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活动详情：全转录组测序 7折
活动时间：2017.9.1-2017.11.30
转录组学是分子生物学研究的重要组成部分，随着科研的深入，获取特定组织或细胞在特定状态下所有转录本（mRNA和非编RNA）信息的总和，已成为科研工作者的迫切需求。全转录组测序技术不仅可同时检测mRNA、lncRNA、circRNA、microRNA，而且可结合多种RNA信息进行ceRNA整合分析，探究其潜在的调控网络机制，已成为解释生物学现象的研究利器。
ceRNA（competitive endogenous RNA，竞争性内源RNA）假说：一种RNA间相互作用的新机制，是指所有类型的RNA都可以通过microRNA应答元件（MREs, microRNA response elements）进行相互作用。
例如，已知miRNA可以通过结合mRNA导致基因沉默，其他非编码RNA（lncRNA/circRNA）则可以通过竞争性的结合miRNA来调节基因表达。
转录本之间通过MREs调节各自的表达水平，含有越多相同MREs的RNA之间能更有效地交流。ceRNA 假说除了能解释所有非编码RNA的功能外，还认为mRNA 除了翻译成蛋白发挥功能外，还能调节其他 mRNA。
mRNA、lncRNA、circRNA都是ceRNA的一份子。
全转录组测序应用领域
- 大规模功能基因的发现（无参考基因组的物种）
- 转录组结构研究：UTRs区域鉴定、Start codon鉴定、内含子边界鉴定、可变剪切研究
- 转录本结构变异研究：融合基因鉴定、cSNP（编码序列单核苷酸多态性）研究
- 非编码区域功能研究：鉴定Non-coding RNA，microRNA前体及成熟的microRNA预测
- 基因表达水平研究：可以定量检测基因的表达水平（RPKM）
- 低丰度新转录本发现
技术优势
- 少量样本
- 2个文库
- 4种RNA
- 全方位分析
技术流程
全转录组文章分享
[1] Kallen A N, Zhou X B, Xu J, et al. The imprinted H19 lncRNA antagonizes let-7 microRNAs[J]. Molecular cell, 2013, 52(1): 101-112.（lncRNA-mRNA）
[2] Caiment F, Gaj S, Claessen S, et al. High-throughput data integration of RNA–miRNA–circRNA reveals novel insights into mechanisms of benzo [a] pyrene-induced carcinogenicity[J]. Nucleic acids research, 2015, 43(5): 2525-2534.（miRNA-mRNA-circRNA）
[3] Jin X, Feng C, Xiang Z, et al. CircRNA expression pattern and circRNA-miRNA-mRNA network in the pathogenesis of nonalcoholic steatohepatitis[J]. Oncotarget, 2016, 7(41): 66455.（circRNA-mRNA-miRNA）
欢迎致电了解详情或咨询当地销售！
dafabet手机黄金版技术（上海）有限公司
地址：上海市漕河泾开发区漕宝路401号3号楼4B
电话：021-60901207/60901208转8003或8010
邮箱：market2@genenergy.cn
全国免费热线：400-9200-612
本活动最终解释权归dafabet手机黄金版所有
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ceRNA（competitive endogenous RNA，竞争性内源RNA）假说：一种RNA间相互作用的新机制，是指所有类型的RNA都可以通过microRNA应答元件（MREs, microRNA response elements）进行相互作用。
例如，已知miRNA可以通过结合mRNA导致基因沉默，其他非编码RNA（lncRNA/circRNA）则可以通过竞争性的结合miRNA来调节基因表达。
转录本之间通过MREs调节各自的表达水平，含有越多相同MREs的RNA之间能更有效地交流。ceRNA 假说除了能解释所有非编码RNA的功能外，还认为mRNA 除了翻译成蛋白发挥功能外，还能调节其他 mRNA。
mRNA、lncRNA、circRNA都是ceRNA的一份子。
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大规模功能基因的发现（无参考基因组的物种）
转录组结构研究：UTRs区域鉴定、Start codon鉴定、内含子边界鉴定、可变剪切研究
转录本结构变异研究：融合基因鉴定、cSNP（编码序列单核苷酸多态性）研究
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[1] Kallen A N, Zhou X B, Xu J, et al. The imprinted H19 lncRNA antagonizes let-7 microRNAs[J]. Molecular cell, 2013, 52(1): 101-112.（lncRNA-mRNA）
[2] Caiment F, Gaj S, Claessen S, et al. High-throughput data integration of RNA–miRNA–circRNA reveals novel insights into mechanisms of benzo [a] pyrene-induced carcinogenicity[J]. Nucleic acids research, 2015, 43(5): 2525-2534.（miRNA-mRNA-circRNA）
[3] Jin X, Feng C, Xiang Z, et al. CircRNA expression pattern and circRNA-miRNA-mRNA network in the pathogenesis of nonalcoholic steatohepatitis[J]. Oncotarget, 2016, 7(41): 66455.（circRNA-mRNA-miRNA）
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