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微生物群落多样性分析是以研究环境中微生物的种类和数量为目的,揭示随环境变化导致微生物群落结构变化的过程。
在国内,微生物多样性的研究涉及农业、土壤、林业、海洋、矿井、人体医学等诸多领域。
dafabet手机黄金版推出 微生物多样性测序 团购 促销活动
活动详情:样本量≥100个 7折
样本量≥200个 6折
样本量≥300个 5折
活动时间:2017.6.16至2017.9.1
测序平台:Illumina Miseq
标准分析内容:OTU聚类和物种注释-α多样性分析、β多样性分析
物种分类-物种组成分析、差异分析、分组评估
样本要求:
DNA样本:样品浓度:≥50ng/ul,总量:1µg/sample,纯度:OD 260/280在1.8~2.0
样品质量:基因组完整、无降解、无污染
样品包装:用封口膜密封样品,DNA低温运输(-20℃)
扩增子测序是研究微生物多样性的重要手段之一。虽比较基础,方法简单,但在微生物多样性的研究中仍占据一席之地。
因为它具有以下优点:
1)价格便宜,仅通过相对简单的测序手段即可获得较理想的结果;
2)不断更新的生物信息学分析技术,可以更多挖掘16S数据中的群落功能信息,分析更为全面;
3)16S测序能在微生物多组学研究中起到基础的群落筛选作用,从而保证为贯穿研究提供准确的多样性信息补充。
扩增子测序是利用保守区设计通用引物进行PCR扩增,再对高变区进行测序分析和菌种鉴定。是研究环境样本中微生物群落结构组成、挖掘样品间差异的重要手段。
根据研究目的的不同,可分四类:16S rDNA测序(一般细菌:V3-V4区)、18S rDNA测序(真核微生物)、ITS测序(真菌)及功能基因区域测序(固氮菌、反硝化菌等特定长度的PCR产物测序)。
标准分析内容
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