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单细胞悬液制备—不同计数方法原理及比较
发布日期:2022-09-21浏览:

开展单细胞转录组测序实验时,需要制备单细胞悬液作为检测样品。单细胞悬液细胞质量是单细胞转录测序实验中关键,而单细胞悬液的状态和质量高低是由细胞活率、细胞浓度、结团率、背景(有核率)等共同影响。目前,在进行单细胞实验中主要使用两种方法进行染色计数,分别是台盼蓝染料(Trypan Blue)和AO/PI荧光染料。其中,台盼蓝染料主要用于显微镜计数(血球计数板法)和countess计数仪,AO/PI荧光染料主要用于countstar计数仪。

 

1.台盼蓝染料

 

台盼蓝染色原理:细胞损伤或死亡时,台盼蓝可穿透变性的细胞膜,与细胞膜内的DNA结合,使其着色。正常的活细胞,胞膜结构完整,能排斥台盼蓝,使之不能够进入细胞内。而丧失活性或细胞膜不完整的细胞,胞膜的通透性增加,可被台盼蓝染成蓝色。通常认为细胞膜完整性丧失,即可认为细胞已经死亡。因此,借助台盼蓝染色可以非常简便、快速地区分活细胞和死细胞。

 

1.1显微镜计数

显微镜计数是一种常用的微生物计数方法。取部分稀释适当的细胞悬液与台盼蓝染料等量混合,放在血球计数板载玻片和盖玻片之间的计数室(0.1mm2)中,在显微镜下直接进行计数(如图1)。

 

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图1 显微镜台盼蓝染色计数

 

1.2 countess计数

Countess计数仪与显微镜计数一样,取部分稀释适当的细胞悬液与台盼蓝染料等量混合。后将细胞加入细胞计数板中,调整焦距和曝光等参数,而后通过countess自带的图像分析和软件算法进行计数。Countess可展示细胞活率、细胞浓度、细胞直径分布等数据(如图2)。


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图2 Countess计数仪台盼蓝染色计数

 

2.AO/PI荧光染料

 

AO/PI荧光染料AO/PI试剂由可以发出绿色荧光的DNA结合染料吖啶橙(AcridineOrange简称AO)和可以发出红色荧光的DNA结合染料碘化丙啶(Propidiumiodide简称PI)组成。两者均是可对DNA染色的细胞核染色试剂。其中 AO可以通过完整的细胞膜,嵌入所有细胞(活细胞和死细胞)的细胞核,呈现绿色荧光;PI只能通过不完整的细胞膜,即死细胞的细胞膜,嵌入所有死细胞的细胞核,呈现红色荧光。当两种染料同时存在于细胞核中,PI通过荧光共振能量转移引起AO荧光的减少。因此,在荧光场中,活细胞的细胞核中仅有AO的存在所以发绿色荧光,被计为活细胞,而细胞膜受损的有核细胞中既有AO又有PI,但是红色荧光盖过了绿色荧光,故被计为死细胞。

 

2.1 Countstar 计数

Countstar计数取部分稀释适当的细胞悬液与AO/PI染料等量混合,通过仪器自带的图像分析和软件算法进行计数。Countstar可展示细胞活率、细胞浓度、细胞直径分布、结团率、有核率等数据(如图3)。

 

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3.不同计数方式比较

 

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