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dafabet手机黄金版推出新服务：单细胞同时检测mRNA+ATAC
发布日期：2021-01-31浏览：
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10x Genomics 的推出全新的单细胞多组学产品 Single Cell Multiome ATAC + Gene Expression：同时检测同一细胞的 ATAC + 基因表达。产品一经推出，受到市场的热烈欢迎。dafabet手机黄金版技术部门已完成样本预实验，现在正式推出服务。下边就让我们一起去探索单细胞多组学的魅力吧。
什么是Chromium单细胞多组学ATAC +基因表达？
全新的Chromium单细胞多组学ATAC + 基因表达，可同时捕获同一单细胞的转录组和表观基因组，为您提供所需的、足够深入的信息去鉴定基因表达模式、细胞类型，以及细胞状态是如何建立的。您能够对样本进行更加深入、高置信度地分析，从而借助关键的基因表达标志物，您可以发现新的基因调控相互作用，或更好地解释表观遗传特征。
Chromium单细胞多组学ATAC +基因表达为同一个细胞提供了多组学分析，对于理解肿瘤异质性的驱动因素，治疗干预的机制以及神经退行性疾病或免疫性疾病的细胞类型具有重要意义。
01 研究领域
癌症生物学；
免疫学；
免疫肿瘤学；
神经科学；
干细胞与发育生物学。
02研究领域
✨ 生物标志物发现；
✨ 细胞谱系与发育过程追踪；
✨ 细胞异质性和稀有细胞群体检测；
✨ 基因调控网络；
✨ 对治疗干预的反应。
03技术优势
💫 将表观基因组学和基因表达谱相结合，从而将发现的能力相乘，以鉴定与RNA序列相关的染色质开放区域；
💫 通过关联的转录组和表观基因组分析来加深对细胞类型和状态的表征；
💫 发现新的基因调控相互作用；
💫 通过关键markers的表达谱轻松解释表观遗传机制；· 通过同一细胞的多组学研究，最大限度地深入了解您宝贵样品的特征。
04研究优势
💥 确定调控元件与其靶基因之间的联系；
💥 简单而强大的工作流程；
💥 易于使用的软件，用于数据分析和可视化。
05系统特性
🔥 一次可以上机8个样本，每个样本可以检测500‒10,000个 细胞核，即一次可以获得多达80000个单细胞的数据；
🔥 单细胞核捕获率最高可达65%；
🔥 高灵敏度；
🔥 线粒体污染率低于1%/1000个细胞核；
🔥 适用于细胞系，原代细胞，新鲜组织，冰冻组织等。
图2 单细胞多组学ATAC +mRNA解决方案工作流程。 通过将基因表达和来自同一细胞的ATACseq数据结合在一起， 以简单，简化的工作流程获得转录和染色质景观的统一视图。从单细胞核悬浮液开始，在将单个核捕获到GEM（Gel Bead-in-emulsion）中进行破油之前，先将DNA片段和mRNA的3'末端加上10x barcodes。然后从每个样品中生成两个互 补的文库，并将基因表达和染色质开放图谱确定地链接回同一细胞。
图4. 单细胞多组学ATAC +mRNA解决方案生成高质量的单细胞基因表达和ATAC文库。 采取小鼠胚胎E18脑组织 样本，分别做了Chromium Single Cell Gene Expression, Chromium Single Cell ATAC, 和 Chromium Single Cell Multiome ATAC + Gene Expression，对比数据的一致性。A.通过每个核的基因中位数及每个核的UMI中位数检测单细胞基因表达 v3.1和单细胞多组学ATAC+基因表达数据的可比性。B.同样，通过每个核的高质量独特片段检测单细胞ATAC v1.1和单细 胞多组学ATAC +基因表达数据的可比性。
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