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发布日期:2020-07-06浏览:

 

 

dafabet手机黄金版的直播间自上线以来,每周四晚8点,邀请行业内专业专家团队,和大家一起分享单细胞测序空间转录组测序等相关课程,获得了热烈的反响!


小编整理汇总了到目前为止的一些课程,供大家参考!感兴趣的小伙伴可以直接扫描文末二维码进入直播间免费报名观看!



系列课

 

dafabet手机黄金版&陈巍学基因翻译:10x单细胞测序用于药业研发

 



课程介绍


 

10x Genomics 官网上有许多关于单细胞测序系列的专业视频,但是外语原声阻挡了一些科研工作者求知的脚步。作为上海市政府认可的单细胞测序服务平台,dafabet手机黄金版现联合“陈巍学基因”创始人陈巍老师,正式开启联合翻译计划,为朋友们提供10x Gemonics网站英文视频的中文字幕翻译版本。

第一系列课主题为《10x单细胞测序在药业研发领域的应用》。







 

单课

 

1


基于Space Ranger实现空间转录组数据分析‍

 



课程介绍


 

本次直播主要介绍Space Ranger的基本原理、主要命令、重要参数及对分析结果进行解读。此外,还将分享在空间转录组分析中经常遇到的问题及经验,比如图片基准点被组织覆盖,spots位点无法识别,如何通过Loupe Browser进行manual alignment人工校正等。







 

 

2


空间转录组学和单细胞RNA测序多模式相交分析‍

 



课程介绍


 

美国纽约大学Itai Yanai团队利用基于微阵列的空间转录组学和单细胞RNA测序(scRNA-seq)揭示了胰腺导管腺癌的组织结构。作者将多模式相交分析应用于原发性胰腺肿瘤,发现导管细胞,巨噬细胞,树突状细胞和癌细胞的亚群具有空间受限的富集,以及与其他细胞类型的独特共富集。2020年1月13日,《自然—生物技术》杂志在线发表了这项成果。

在本周直播课中,陈巍老师将和大家一起对这篇文章进行解读。







 

3


从全器官尺度绘制人类心脏发育的单细胞基因表达时空图谱‍

 



课程介绍


 

2019年12月12日,瑞典皇家理工学院Joakim Lundeberg、Michaela Asp等研究人员合作在Cell上发表了题为《A Spatiotemporal Organ-Wide Gene Expression and Cell Atlas of the Developing Human Heart》的论文,以胎龄分别为4.5周、6.5周、9周的人类胚胎心脏样本为研究对象,综合利用单细胞转录组测序、空间转录组测序和RNA原位杂交等实验技术及细胞空间概率分型的计算方法,首次从全器官尺度绘制了人类心脏发育的单细胞基因表达时空图谱。

在本次直播课中,陈巍老师将和大家一起对这篇文章进行解读。







 

4


解读全球首篇10x Visium空间转录组测序应用文章‍

 



课程介绍


 

2020年3月,全球首篇使用10x Genomics 的商用Visium空间转库组测序技术的文章由Kristen R. Maynard发表在 BioRxiv的预印文章《Transcriptome-scale spatial gene expression in the human dorsolateral prefrontal cortex》标志着10x  Genomics Visium空间基因表达解决方案开启了新的篇章。

在本次直播课中,陈巍老师将和大家一起解读这篇文章,分享大脑皮层在不同的位置的特异的基因表达。

 







 

5


空间转录组测序图表数据挖掘思路&分析方法‍

 



课程介绍


 

空间转录组产生海量的数据,这些数据经过统计后会产生大量的图表,我们拿到测序图表数据结果之后,如何针对自己的方案设计与研究思路对数据进行深入挖掘,得到其中的关键信息与结果呢?本节课由陈巍老师跟大家分享一下空间转录组测序数据如何进行深入挖掘和分析。
 







 

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