如果你正在使用“某种疾病的大panel检测突变位点”;
如果你关注“外显子区域的CNV”;
如果你的样本“起始模板量低”;
…
Twist人核心外显子组捕获试剂盒适合你。
因为,Twist人核心外显子组捕获试剂盒,
是常备试剂,备货灵活;
它检测性能优越,具有卓越的捕获覆盖均一度;
配备高保真双链DNA探针,大大提高模板利用率;
超高性价比。
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为什么推荐使用“Twist人核心外显子捕获试剂盒”?
? 高效的CCDS/refgene CDS区域覆盖
? 高度均一性
1. twist的The fold 80 base penalty为1.43,竞品为2.0。Fold80 越大,均一性越差,一般2以内均一性较好。(标准品测试结果)
注:Fold80表示平均深度/(80%以上区域被覆盖的深度)。
2. 覆盖图显示,与竞争对手相比,Twist 所生成的数据具有更高均一性,降低测序成本。(标准品测试结果)
注:左图:覆盖度小于 30x 的区域数量比竞品低,在6G有效数据量时,覆盖度大于 30x的区域便可达到95%。
右图:15G数据量时,TwistCR的峰值深度比竞品大,数据利用率高。
dafabet手机黄金版全新推出“人核心外显子组完整解决方案”
在科研及临床中,基因组分析的核心是致病突变的鉴定,从而确定在正常生物学和疾病状态中发挥作用的分子通路。靶向测序(特别是全外显子测序),能有效的将测序成本集中在目标基因组范围内,是临床或基础研究中检测致病突变的有力方法。
但在实验过程中,特别的针对一些高度重复、GC含量高的基因组区域,常有区域特异性偏好和不均一性,这都极大的影响着整体数据质量和分析效率。
dafabet手机黄金版全新推出「人核心外显子组测序服务」,采用全新定制的Twist Bioscience NGS靶向富集试剂盒,高效覆盖人CCDS的高度保守蛋白编码区域,提供高度均一且优化良好的捕获方案,适用于多种应用。
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? 两个版本
? 样本要求
? 分析方向和内容
Twist靶向捕获应用实例
本研究构建了正常组织类器官和肾细胞癌组织培养的类器官模型,并将其与原代组织的多种反应进行表征和比较。研究发表于2019年2月《Cell Death and Disease》杂志。
研究外显子测序部分,作者使用Twist Bioscience人核心外显子组试剂盒对3个肾细胞癌患者的正常组织类器官、肿瘤类器官、亲代正常组织和亲代肿瘤组织的外显子进行富集测序,并对检测到的突变进行比较。
结果显示,肿瘤类器官与亲代肿瘤组织之间有95%的相关性,且肿瘤类器官为具有不同基因组的异质性细胞混合物;还发现肿瘤类器官中含有与肾透明细胞癌紧密相关的突变。
所以说明,类器官模型与原代患者组织具有非常高的基因组相关性,从而为获得更安全的肾细胞癌治疗药物提供帮助。
参考文献:
Grassi L, Alfonsi R, Francescangeli F, et al. Organoids as a new model for improving regenerative medicine and cancer personalized therapy in renal diseases. Cell Death Dis. 2019;10(3):201