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dafabet手机黄金版10x Genomics单细胞转录组测序完整解决方案

2016年dafabet手机黄金版引进10x Genomics Chromium系统开启单细胞测序服务。服务至今，已处理400+个样本，样本来源人、小鼠、猪、猴子等，细胞类型涵盖外周血单核细胞（PBMC）、干细胞、神经细胞、胚胎细胞、骨髓细胞、免疫细胞等。2018年dafabet手机黄金版开始10x Genomics免疫谱分析，累计服务样本数20+。

（dafabet手机黄金版实拍图）

三台仪器，不间断服务，为各地科研工作者提供上门文库构建服务。

降维聚类图（PCA和TSNE图示例）

拟时轨迹曲线图（示例）

细胞marker gene功能分析

典型应用案例解析

1. 肿瘤异质性：脑胶质瘤、黑色素瘤、乳腺癌、前列腺癌等

研究人员通过单细胞转录组测序分析的方法，在移植瘤或正常心脏中活性血管生成期间，研究小鼠内皮细胞及其他基质细胞的异质性。他们将肿瘤内皮细胞分为三个亚群，还对其他肿瘤基质细胞进行了表型分类，发现肿瘤相关成纤维细胞（TAF）通过上调缺氧相关基因并产生与血管生成有关的分泌因子来对抗血管生成药物治疗作出反应。总体而言，此研究更好地定义了肿瘤内皮细胞和其他基质细胞的异质性，揭示了VEGF和Dll4-Notch在指定肿瘤内皮表型中的作用，突出了基质细胞对抗血管生成治疗的反应。（Cancer Res; 78(9); 2370–82.）

2. 胚胎发育：胚胎干细胞分化、植入前胚胎筛查

皮层中间神经元的多种亚群在高阶脑功能中起着至关重要的作用。为研究如何产生这种多样性，研究人员选择单细胞RNA测序来描绘沿着发育时间收集到的小鼠细胞的转录表达情况。通过整合不同发育时间点的数据集，确定了成体中间神经元及其前体之间转录组异质性的共同来源，并揭示了主要中间神经元亚型的胚胎发生。（Nature. 2018 Mar 22; 555(7697): 457-462.）

3. 细胞图谱

心脏纤维素的形成，对于理解心脏发育和正常器官功能以及制定精确的对抗心脏病的治疗策略必不可少。研究人员使用单细胞RNA测序对小鼠非心肌细胞的单细胞转录谱进行了全面的分析，揭示了心脏纤维素的多样性及广泛的细胞间通讯网络。研究重塑了作者对心脏细胞组成的理解，并强调了非心肌细胞类型的重要作用。（Cell Rep. 2018 Jan 16; 22(3): 600-610.）

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