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总结 | 单细胞研究之10x Genomics单细胞转录组测序
发布日期：2018-05-03浏览： 次
研究背景
 
细胞异质性（heterogeneity）：同一类型细胞中可以存在很多不同的基因型或者亚型的细胞，因此同一种类型细胞在不同的个体甚至同一个体中存在分子生物学、表型、功能等方面的特性和差异。异质性存在于生殖细胞、胚胎细胞、神经细胞、免疫细胞、干细胞、肿瘤细胞等细胞中，这一特征使得单细胞测序研究具有重要意义，所谓的单细胞测序（single cell sequencing，SCS）是指对单个细胞进行DNA或RNA测序，在此我们主要介绍10x Genomics ChromiumTM 平台单细胞3’端转录组测序的研究应用。
 
技术优势
 
10x Genomics的技术核心是利用微流控芯片对细胞进行有效区分，保证每个小的反应体系（Gel Bead in Emulsion，GEM）中仅有一个单细胞。具备以下技术优势：
-不需要微量扩增，降低假阳性率
-真正的单细胞水平测序，Doublet rate：0.9%/1000个细胞
-灵活的获取量，可一次性对100-80000个细胞建库，提高效率
-7分钟之内即可完成单细胞体系制备，捕获效率高达65％
-广泛的研究应用领域，超短的项目周期
 
应用成果
 
从2016年底至今，10x Genomics ChromiumTM单细胞3’端转录组测序在单细胞研究领域硕果累累，先后发表了40余篇高影响因子文章，其中不乏Nature、Cell等著名期刊。所研究的细胞涵盖PBMC、神经、小肠等多种类型，研究方向主要涉及构建细胞图谱、发育分化、癌症和免疫研究等。
 
  
已发表 10x 单细胞转录组文章（影响因子分布＆文章类型）
 
 
研究领域
 
 
 
细胞类型
生殖细胞、胚胎细胞、神经细胞、免疫细胞、肿瘤细胞、干细胞、其他原代细胞
 
样本要求
样本类型：动物细胞 - 单细胞悬液；植物细胞 - 原生质体。
细胞状态：细胞直径＜30 μm；细胞活性＞90%；细胞浓度 5×105~1.2×105/ml；不含 Ca2+ 和 Mg2+。
细胞数目：上门提取：≥ 1×105 cells/sample；
                  样本寄送：≥ 2×105 cells/sample。
保存运输：为了减少运输过程及反复冻融对细胞造成的损伤，dafabet黄金手机版提供上门服务！
 
项目经验
我们具有丰富的项目经验，稳定成熟的实验技术，处理过各种类型的细胞，除完善的标准分析内容之外，还兼具个性化的高级分析内容，只要您有想法我们愿为您的论文锦上添花！
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